Processed File: 4790_shifty.txt
CSI and Sec Structure (4790_shifty.txt)

SeqCCACBNHHABeta sheet probabilityCoil probabilityHelix probabilitySecStr
T1  61.93 69.55   4.28 0.44 0.54 0.02 C 
V2  59.65 32.75   4.38 0.84 0.16 0.00 B 
P3  62.95 31.99   4.38 0.15 0.84 0.01 C 
D4  54.57 41.12   4.45 0.08 0.88 0.03 C 
N5       0.26 0.59 0.16 C 
H6  56.60 30.47   4.45 0.10 0.78 0.12 C 
R7       0.31 0.36 0.33 C 
N8  53.05 38.59   4.68 0.10 0.84 0.05 C 
K9  55.34 35.29   5.17 0.99 0.01 0.00 B 
F10  56.35 42.65   4.48 0.79 0.21 0.00 B 
K11  57.62 31.99   4.71 0.09 0.89 0.02 C 
V12  58.89 37.06   5.58 1.00 0.00 0.00 B 
I13  60.66 42.39   4.84 0.98 0.02 0.00 B 
N14  54.32 40.36   4.53 0.10 0.71 0.19 C 
V15  58.63 36.05   5.54 1.00 0.00 0.00 B 
D16  51.27 41.63   4.45 0.15 0.85 0.00 C 
D17  56.86 41.63   4.13 0.01 0.19 0.80 H 
D18  53.81 42.39   4.76 0.29 0.71 0.00 C 
G19  45.19     0.11 0.87 0.02 C 
N20  53.56 38.08   4.46 0.05 0.76 0.19 C 
E21  57.37 29.70   4.01 0.01 0.52 0.47 C 
L22  53.56 41.63   4.52 0.48 0.52 0.00 C 
G23       0.12 0.81 0.08 C 
S24  57.37 65.74   5.43 0.99 0.01 0.00 B 
G25       0.12 0.81 0.08 C 
I26  58.38 40.87   4.99 0.99 0.01 0.00 B 
M27  53.30 36.56   5.63 1.00 0.00 0.00 B 
E28  53.81 34.53   5.43 1.00 0.00 0.00 B 
L29  54.57 42.14   5.01 0.85 0.15 0.00 B 
T30  59.65 69.80   4.96 0.90 0.10 0.00 B 
D31  57.11 40.36   4.57 0.01 0.17 0.82 H 
T32  61.93 71.83   4.36 0.50 0.50 0.00 C 
E33  57.62 34.02   4.48 0.67 0.33 0.00 B 
L34  54.32 44.42   4.89 0.93 0.07 0.00 B 
I35  60.66 40.87   4.68 0.92 0.08 0.00 B 
L36  53.05 46.20   5.24 1.00 0.00 0.00 B 
Y37  56.60 39.60   5.08 0.87 0.13 0.00 B 
T38  60.92 70.82   4.75 0.81 0.19 0.00 B 
R39       0.31 0.36 0.33 C 
K40  57.11 31.48   4.10 0.01 0.59 0.39 C 
R41  56.10 30.21   4.34 0.12 0.78 0.09 C 
D42  54.32 41.38   4.77 0.18 0.82 0.00 C 
S43  57.11 65.49   5.15 0.95 0.05 0.00 B 
V44  60.92 34.02   3.97 0.74 0.26 0.00 B 
K45  54.07 36.30   5.28 1.00 0.00 0.00 B 
W46  58.13 31.48   4.66 0.62 0.34 0.05 B 
H47  57.62 30.97   4.48 0.06 0.65 0.29 C 
Y48  60.41 36.81   4.30 0.00 0.20 0.80 H 
L49  56.35 41.38   4.30 0.01 0.37 0.61 H 
C50  57.62 28.69   5.06 0.86 0.14 0.01 B 
L51  55.84 42.39   4.61 0.21 0.74 0.05 C 
R52  56.35 32.50   4.71 0.62 0.38 0.00 B 
R53  54.83 34.53   5.33 1.00 0.00 0.00 B 
Y54  57.62 40.36   5.48 0.97 0.03 0.00 B 
G55  47.72     0.05 0.46 0.49 H 
Y56  55.84 43.15   5.76 1.00 0.00 0.00 B 
D57  52.80 44.93   4.28 0.61 0.39 0.00 B 
S58  60.66 62.44   4.24 0.00 0.22 0.78 H 
N59  53.30 39.09   5.17 0.39 0.61 0.00 C 
L60  54.83 47.22   5.40 1.00 0.00 0.00 B 
F61  56.10 44.17   5.57 1.00 0.00 0.00 B 
S62  54.83 65.99   5.41 0.99 0.01 0.00 B 
F63  56.10 42.39   5.32 0.97 0.03 0.00 B 
E64  53.05 33.51   5.69 1.00 0.00 0.00 B 
S65  57.11 68.78   5.29 1.00 0.00 0.00 B 
G66       0.12 0.81 0.08 C 
R67  58.63 31.48   4.08 0.00 0.26 0.73 H 
R68  55.34 27.67   4.52 0.13 0.86 0.00 C 
C69  56.35 29.96   4.87 0.83 0.16 0.01 B 
Q70  59.40 28.94   4.05 0.00 0.06 0.94 H 
T71  63.71 71.32   4.15 0.25 0.70 0.05 C 
G72  43.92     0.18 0.81 0.00 C 
Q73  55.59 28.69   4.19 0.08 0.79 0.13 C 
G74  45.19     0.11 0.87 0.02 C 
I75  60.41 39.35   4.18 0.57 0.43 0.00 B 
F76  55.34 42.90   4.73 0.88 0.11 0.00 B 
A77  51.27 23.36   5.18 1.00 0.00 0.00 B 
F78  55.84 42.90   5.40 0.98 0.02 0.00 B 
K79  56.10 33.51   5.19 0.95 0.05 0.00 B 
C80  58.89 28.94   4.68 0.50 0.35 0.15 B 
A81  54.83 18.29   4.58 0.00 0.32 0.67 H 
R82  54.57 30.97   4.98 0.88 0.12 0.00 B 
A83  56.86 19.55   3.59 0.00 0.16 0.84 H 
E84  59.40 29.70   2.63 0.46 0.54 0.00 C 
E85  59.65 30.21   3.96 0.00 0.07 0.93 H 
L86  59.40 41.38   3.00 0.00 0.01 0.99 H 
F87  62.19 40.11   3.82 0.00 0.02 0.98 H 
N88  55.84 37.83   4.21 0.00 0.17 0.83 H 
M89  57.27 32.50   4.10 0.00 0.18 0.82 H 
L90  57.62 40.87   3.63 0.00 0.01 0.99 H 
Q91  59.14 29.45   3.90 0.00 0.07 0.93 H 
E92  59.65 29.45   3.92 0.00 0.04 0.96 H 
I93  65.49 38.59   3.57 0.00 0.01 0.99 H 
M94  59.14 30.72   3.88 0.00 0.02 0.98 H 
Q95  58.89 28.18   4.13 0.00 0.08 0.92 H 
N96  55.34 32.50   4.52 0.02 0.36 0.62 H 
N97  53.56 40.11   4.79 0.20 0.76 0.03 C 
S98      4.74 0.41 0.57 0.02 C 
I99  60.16 38.08   4.08 0.42 0.57 0.01 C 
N100  53.81 39.09   4.63 0.08 0.77 0.15 C 
V101  59.65 34.53   4.95 0.99 0.01 0.00 B 
V102  60.66 34.78   4.35 0.93 0.07 0.00 B 
E103  56.60 30.21   4.49 0.20 0.80 0.00 C 
E104  53.81 30.21   4.67 0.74 0.26 0.00 B 
P105  62.95 31.99   4.46 0.16 0.83 0.01 C 
V106  62.70 32.50   4.06 0.35 0.64 0.00 C 
V107  61.93 33.00   4.08 0.55 0.45 0.00 B 
E108  56.35 29.96   4.25 0.11 0.88 0.01 C 
R109  56.10 30.97   4.30 0.16 0.77 0.07 C 
N110       0.26 0.59 0.16 C 
N111       0.26 0.59 0.16 C 
H112       0.33 0.52 0.14 C 
Q113       0.29 0.38 0.33 C 
T114  62.19 69.55   4.28 0.42 0.55 0.03 C 
E115  56.35 29.70   4.27 0.10 0.88 0.01 C 
L116  55.34 42.65   4.30 0.17 0.76 0.07 C 
E117       0.32 0.33 0.35 H 
V118      4.23 0.65 0.28 0.07 B 

CSI and Sec Structure (No_Deviant_Ref_Calibrated)

SeqCCACBNHHABeta sheet probabilityCoil probabilityHelix probabilitySecStr
T1  61.75 69.33   4.28 0.44 0.55 0.02 C 
V2  59.47 32.53   4.38 0.83 0.17 0.00 B 
P3  62.77 31.77   4.38 0.16 0.84 0.01 C 
D4  54.39 40.90   4.45 0.08 0.90 0.02 C 
N5       0.26 0.59 0.16 C 
H6  56.42 30.25   4.45 0.10 0.80 0.10 C 
R7       0.31 0.36 0.33 C 
N8  52.87 38.37   4.68 0.10 0.85 0.04 C 
K9  55.16 35.07   5.17 0.99 0.01 0.00 B 
F10  56.17 42.43   4.48 0.78 0.22 0.00 B 
K11  57.44 31.77   4.71 0.11 0.88 0.01 C 
V12  58.71 36.84   5.58 1.00 0.00 0.00 B 
I13  60.48 42.17   4.84 0.98 0.02 0.00 B 
N14  54.14 40.14   4.53 0.09 0.73 0.18 C 
V15  58.45 35.83   5.54 1.00 0.00 0.00 B 
D16  51.09 41.41   4.45 0.14 0.86 0.00 C 
D17  56.68 41.41   4.13 0.01 0.21 0.77 H 
D18  53.63 42.17   4.76 0.27 0.73 0.00 C 
G19  45.01     0.12 0.87 0.01 C 
N20  53.38 37.86   4.46 0.05 0.80 0.15 C 
E21  57.19 29.48   4.01 0.02 0.60 0.38 C 
L22  53.38 41.41   4.52 0.47 0.53 0.00 C 
G23       0.12 0.81 0.08 C 
S24  57.19 65.52   5.43 0.99 0.01 0.00 B 
G25       0.12 0.81 0.08 C 
I26  58.20 40.65   4.99 0.99 0.01 0.00 B 
M27  53.12 36.34   5.63 0.99 0.01 0.00 B 
E28  53.63 34.31   5.43 1.00 0.00 0.00 B 
L29  54.39 41.92   5.01 0.85 0.15 0.00 B 
T30  59.47 69.58   4.96 0.89 0.11 0.00 B 
D31  56.93 40.14   4.57 0.01 0.20 0.80 H 
T32  61.75 71.61   4.36 0.53 0.47 0.00 B 
E33  57.44 33.80   4.48 0.67 0.33 0.00 B 
L34  54.14 44.20   4.89 0.93 0.07 0.00 B 
I35  60.48 40.65   4.68 0.92 0.08 0.00 B 
L36  52.87 45.98   5.24 1.00 0.00 0.00 B 
Y37  56.42 39.38   5.08 0.86 0.14 0.00 B 
T38  60.74 70.60   4.75 0.82 0.18 0.00 B 
R39       0.31 0.36 0.33 C 
K40  56.93 31.26   4.10 0.02 0.67 0.31 C 
R41  55.92 29.99   4.34 0.13 0.80 0.07 C 
D42  54.14 41.16   4.77 0.17 0.83 0.00 C 
S43  56.93 65.27   5.15 0.95 0.05 0.00 B 
V44  60.74 33.80   3.97 0.72 0.28 0.00 B 
K45  53.89 36.08   5.28 1.00 0.00 0.00 B 
W46  57.95 31.26   4.66 0.60 0.36 0.05 B 
H47  57.44 30.75   4.48 0.06 0.68 0.26 C 
Y48  60.23 36.59   4.30 0.00 0.24 0.76 H 
L49  56.17 41.16   4.30 0.02 0.44 0.54 H 
C50  57.44 28.47   5.06 0.86 0.13 0.01 B 
L51  55.66 42.17   4.61 0.23 0.73 0.03 C 
R52  56.17 32.28   4.71 0.62 0.38 0.00 B 
R53  54.65 34.31   5.33 1.00 0.00 0.00 B 
Y54  57.44 40.14   5.48 0.97 0.03 0.00 B 
G55  47.54     0.05 0.52 0.43 C 
Y56  55.66 42.93   5.76 1.00 0.00 0.00 B 
D57  52.62 44.71   4.28 0.57 0.43 0.00 B 
S58  60.48 62.22   4.24 0.00 0.24 0.76 H 
N59  53.12 38.87   5.17 0.39 0.61 0.00 C 
L60  54.65 47.00   5.40 1.00 0.00 0.00 B 
F61  55.92 43.95   5.57 1.00 0.00 0.00 B 
S62  54.65 65.77   5.41 0.99 0.01 0.00 B 
F63  55.92 42.17   5.32 0.97 0.03 0.00 B 
E64  52.87 33.29   5.69 1.00 0.00 0.00 B 
S65  56.93 68.56   5.29 1.00 0.00 0.00 B 
G66       0.12 0.81 0.08 C 
R67  58.45 31.26   4.08 0.00 0.25 0.75 H 
R68  55.16 27.45   4.52 0.13 0.86 0.00 C 
C69  56.17 29.74   4.87 0.84 0.15 0.01 B 
Q70  59.22 28.72   4.05 0.00 0.06 0.94 H 
T71  63.53 71.10   4.15 0.27 0.67 0.06 C 
G72  43.74     0.20 0.80 0.00 C 
Q73  55.41 28.47   4.19 0.09 0.81 0.10 C 
G74  45.01     0.12 0.87 0.01 C 
I75  60.23 39.13   4.18 0.57 0.42 0.00 B 
F76  55.16 42.68   4.73 0.87 0.13 0.00 B 
A77  51.09 23.14   5.18 1.00 0.00 0.00 B 
F78  55.66 42.68   5.40 0.98 0.02 0.00 B 
K79  55.92 33.29   5.19 0.95 0.05 0.00 B 
C80  58.71 28.72   4.68 0.53 0.34 0.13 B 
A81  54.65 18.07   4.58 0.00 0.34 0.66 H 
R82  54.39 30.75   4.98 0.88 0.12 0.00 B 
A83  56.68 19.33   3.59 0.00 0.11 0.89 H 
E84  59.22 29.48   2.63 0.51 0.49 0.00 B 
E85  59.47 29.99   3.96 0.00 0.06 0.94 H 
L86  59.22 41.16   3.00 0.00 0.01 0.99 H 
F87  62.01 39.89   3.82 0.00 0.02 0.98 H 
N88  55.66 37.61   4.21 0.00 0.20 0.79 H 
M89  57.09 32.28   4.10 0.00 0.20 0.80 H 
L90  57.44 40.65   3.63 0.00 0.01 0.99 H 
Q91  58.96 29.23   3.90 0.00 0.07 0.93 H 
E92  59.47 29.23   3.92 0.00 0.04 0.96 H 
I93  65.31 38.37   3.57 0.00 0.01 0.99 H 
M94  58.96 30.50   3.88 0.00 0.02 0.98 H 
Q95  58.71 27.96   4.13 0.00 0.08 0.92 H 
N96  55.16    4.52 0.02 0.41 0.57 H 
N97  53.38 39.89   4.79 0.20 0.77 0.03 C 
S98      4.74 0.41 0.57 0.02 C 
I99  59.98 37.86   4.08 0.43 0.57 0.00 C 
N100  53.63 38.87   4.63 0.08 0.79 0.13 C 
V101  59.47 34.31   4.95 0.99 0.01 0.00 B 
V102  60.48 34.56   4.35 0.93 0.07 0.00 B 
E103  56.42 29.99   4.49 0.21 0.79 0.00 C 
E104  53.63 29.99   4.67 0.72 0.28 0.00 B 
P105  62.77 31.77   4.46 0.17 0.83 0.01 C 
V106  62.52 32.28   4.06 0.36 0.63 0.00 C 
V107  61.75 32.78   4.08 0.55 0.45 0.00 B 
E108  56.17 29.74   4.25 0.12 0.88 0.01 C 
R109  55.92 30.75   4.30 0.17 0.77 0.06 C 
N110       0.26 0.59 0.16 C 
N111       0.26 0.59 0.16 C 
H112       0.33 0.52 0.14 C 
Q113       0.29 0.38 0.33 C 
T114  62.01 69.33   4.28 0.41 0.56 0.03 C 
E115  56.17 29.48   4.27 0.11 0.88 0.01 C 
L116  55.16 42.43   4.30 0.19 0.77 0.05 C 
E117       0.32 0.33 0.35 H 
V118      4.23 0.65 0.28 0.07 B 

Validation

3-Resdue Scan:

TVPDNHRNKF KVINVDDDGN ELGSGIMELT DTELILYTRK RDSVKWHYLC LRRYGYDSNL FSFESGRRCQ TGQGIFAFKC ARAEELFNML QEIMQNNSIN VVEEPVVERN NHQTELEV

Original Assigment and Probability vs Suggested Assignment and Probability

DNH(4-6) 47.20% LRR(51-53) 100%
HRN(6-8) 45.49% RNN(109-111) 100%
NVD(14-16) 6.83% LFN(86-88) 100%
VDD(15-17) 18.37% RNN(109-111) 100%
SGI(24-26) 32.69% SNL(58-60) 100%
YTR(37-39) 48.11% DTE(31-33) 100%
HYL(47-49) 41.29% VIN(12-14) 100%
LRR(51-53) 78.19% NHR(5-7) 100%
SGR(65-67) 52.89% SVK(43-45) 100%
GRR(66-68) 12.60% VKW(44-46) 100%
RRC(67-69) 8.03% KWH(45-47) 100%
CQT(69-71) 63.76% HQT(112-114) 100%
GIF(74-76) 70.92% GYD(55-57) 100%
FKC(78-80) 73.14% NHQ(111-113) 100%
CAR(80-82) 82.01% RAE(82-84) 100%
NNS(96-98) 35.32% DDD(16-18) 100%
SIN(98-100) 86.09% VIN(12-14) 100%
VVE(101-103) 47.12% VKW(44-46) 100%
VER(107-109) 68.57% VEE(102-104) 100%
ERN(108-110) 68.57% EEL(84-86) 100%

# of selected frags: 109; # of confirmed frags: 89; CONA Score: 81.65%

4-Resdue Scan:

TVPDNHRNKF KVINVDDDGN ELGSGIMELT DTELILYTRK RDSVKWHYLC LRRYGYDSNL FSFESGRRCQ TGQGIFAFKC ARAEELFNML QEIMQNNSIN VVEEPVVERN NHQTELEV

Original Assigment and Probability vs Suggested Assignment and Probability

DNHR(4-7) 47.20% LRRY(51-54) 100%
NHRN(5-8) 45.49% ERNN(108-111) 100%
GSGI(23-26) 32.69% DSNL(57-60) 100%
WHYL(46-49) 73.43% KVIN(11-14) 100%
SGRR(65-68) 12.60% SVKW(43-46) 100%
GRRC(66-69) 8.03% VKWH(44-47) 100%
SINV(98-101) 86.09% VINV(12-15) 100%
VVER(106-109) 68.57% VVEE(101-104) 100%
VERN(107-110) 68.57% VEEP(102-105) 100%
ERNN(108-111) 68.57% EELF(84-87) 100%
ELEV(115-118) 51.67% ELGS(21-24) 100%

# of selected frags: 112; # of confirmed frags: 101; CONA Score: 90.18%

5-Resdue Scan:

TVPDNHRNKF KVINVDDDGN ELGSGIMELT DTELILYTRK RDSVKWHYLC LRRYGYDSNL FSFESGRRCQ TGQGIFAFKC ARAEELFNML QEIMQNNSIN VVEEPVVERN NHQTELEV

Original Assigment and Probability vs Suggested Assignment and Probability

GIMEL(25-29) 9.06% LFNML(86-90) 100%
SGRRC(65-69) 8.03% SVKWH(43-47) 100%
VVERN(106-110) 68.57% VVEEP(101-105) 100%
VERNN(107-111) 68.57% VEEPV(102-106) 100%

# of selected frags: 110; # of confirmed frags: 106; CONA Score: 96.36%

6-Resdue Scan:

TVPDNHRNKF KVINVDDDGN ELGSGIMELT DTELILYTRK RDSVKWHYLC LRRYGYDSNL FSFESGRRCQ TGQGIFAFKC ARAEELFNML QEIMQNNSIN VVEEPVVERN NHQTELEV

Original Assigment and Probability vs Suggested Assignment and Probability

VVERNN(106-111) 68.57% VVEEPV(101-106) 100%
VERNNH(107-112) 68.57% VEEPVV(102-107) 100%

# of selected frags: 110; # of confirmed frags: 108; CONA Score: 98.18%


Reference Offsets and Deviant Shifts

Detected reference offsets
CO: 0.00ppm CA: -0.18ppm CB: -0.22ppm N: 0.00ppm

Num of Assignments: 309
Number of of Deviant Assignments: 1
N96 CB: 32.50

Num of Suspicous Assignments after ref-calibration when necessary: 1
E84 HA: 2.63